К началу войны вся промышленность района была представлена тремя промысловыми артелями. Работали швейный, сапожный, жестяной, мочальный и пимокатный цеха; кирпичный завод; маслозаводы – в поселке Янаул, деревнях Ямады, Рабак.
Сельское хозяйство представляли Янаульская, Байгузинская, Ямадинская МТС, в хозяйстве которых имелись 82 маломощных трактора, 63 комбайна и 66 автомашин.
Большая помощь была оказана 112-й Башкирской кавалерийской дивизии. В 1942 году начальник политотдела Башкирской кавалерийской дивизии прислал телеграмму на имя исполкома райсовета и райкома партии: «Выражаю вам красноармейскую благодарность за оказание большевистской заботы о бойцах вашего района, которые находятся в нашей дивизии. Глубоко сознаю вашу заботу и помощь, мы с мужеством, не жалея крови и жизни будем драться до полной победы над немецкими фашистами».
Артель «Ударник» с 1941 года переключился на изготовление меха для фронта. Артель «Красный Октябрь» занимался пошивом одежды, изготовлением валенок. Артель «Ярыш» организовала мыловаренье и отправила на фронт 20 т мыла. 7 октября 1942 года решением райисполкома были установлены следующие виды и объемы работ для нужд фронта на каждый месяц:
пошив полушубков – 140 штук,
изготовление валенок – 480 пар,
выделка шубных овчин – 600 штук,
изготовление кошмы – 800 кг.
14 декабря 1942 года бюро РК ВП(б), исполком райсовета приняли совместное решение «Об организации сбора средств от трудящихся района на строительства авиаэскадрильи «Башкирский истребитель». Многие безвозмездно отдавали свои личные сбережения для строительства самолетов, танков и другой техники. Уже в первый год войны янаульцы внесли в фонд обороны 394 тыс. рублей, а председатель колхоза «Парижская коммуна» Рахима Гайнетдинова внесла в фонд строительства самолетов из своих личных сбережений 50 тыс. рублей. Всего за годы войны внесено более 6 млн рублей.
Основной задачей трудящихся района в военные годы все же было обеспечение фронта продовольствием. В период войны самоотверженно работали труженики колхозов «Коммунар» председатель Давлетшин Мингарай, «Урал» - председатель Г. Ханов , «Азат» - председатель Шакиров Ямалетдин, имени Чкалова-председатель Байгузин и другие.
В колхозе «Тан», д. Кумалак, весь военный период председателем работала Шангараева. Артель с успехом выполнила все государственные задания и была одной из передовых в районе. В колхозе имени Чапаева, деревня Нократово, председателем работала М. Гильмутдинова, в колхозе имени Худайбердина председателем была З. Ситдыкова, в колхозе имени Сталина, деревня Никольск, председателем была Кудряшова, в колхозе «Алга», деревня Новый Куюк, председателем была Н. Фатихова, в колхозе «Урал» председателем была Музипова Галима и другие. Женских тракторных бригад возглавили Фаузия Салахова, Таскира Халипова. Девушки-трактористки: Нурания Миндуллина, Рашида Шамгунова, Лиза Ишимбаева.
В годы войны трудящиеся района оказали большую помощь освобожденным областям. Колхозники сельхозартели имени Ворошилова выделили освобожденным районам Ворошиловградской области 40 ц картофеля, 9 ц зерна, 50 голов птицы, 7 овец. В фонд помощи посеяно сверх плана 5 га ржи.
За образцовое выполнение задания фронта в 1943 году трудящиеся района получили благодарность ЦК партии и советского правительства, а в 1944 году - благодарность за образцовое выполнение плана по заготовкам сельхозпродуктов и сбора денежных средств. Председатели колхозов «Азат» и «Урал» Ямалетдин Шакиров и Галима Музипова были удостоены высшей правительственной награды Ордена Ленина, председатель колхоза «Коммунар» Мингарай Давлетшин-Орденом Красного Знамени. Эти хозяйства успешно выполняли все государственные задания, были маяками в районе.
В мае 1943 года по приказу начальника Главного управления Гражданского Воздушного Флота (ГВФ) №034-43 г. на базе 111-1 Исиль-Кульской и 74-ой Шадринской авиаэскадрилий, а также летного состава 71-ой Янаульской авиаэскадрильи была создана Исиль-Кульская авиашкола первоначального обучения Гражданского Воздушного Флота. Здесь они получали первые теоретические знания и практические навыки самолетовождения. Преподавателей и инструкторов для учебных авиаэскадрилий подбирали из числа самых опытных летчиков. Серафима Тарасовна Амосова была назначена командиром звена эскадрильи, созданной при Янаульском аэропорте.
Военная летная школа базировалась вблизи д. Рабак, где дислоцировалась группа офицеров и курсантов военного летного училища. Летом 1943 года приземлились первые учебные самолеты ПО-2. Здесь же базировался Дзержинский аэроклуб г. Москвы.
В 1943 году в п. Янауле расположился эвакогоспиталь №3551. Госпиталь обслуживал персонал в количестве 100 человек из мобилизованных и вольнонаемных жителей района и эвакуированных.
В октябре 1943 года по приказу ГКО госпиталь выехал работать во фронтовых условиях. Этапы фронтового пути эвакогоспиталя №3551 - Орел, Тула, Брянск, Клинцы, Новозыбков, Брест, Мрозы, Модлин, Липпо, Новозыбков, Брютово, Шверин. Госпиталь находился в составе 70-й армии на фронтах Ценрально - Брянском, I и II Белорусском, II и V Украинском. В 1946 году госпиталь был расформирован.
В деревнях Бадряшево и Максимово работали детские дома, эвакуированные из западных областей страны.
Лоскутов Виктор Георгиевич
(27 сентября 1923 года - 23 февраля 1970 года), Герой Советского Союза, майор. На фронтах войны с 1944 года, лётчик 34-го ближнебомбардировочного авиационного полка 10-й авиационной дивизии пикирующих бомбардировщиков Военно-воздушных сил Тихоокеанского флота.
Хайдаршин Гайнанша Хайдаршинович
(23 января 1911 года - 3 декабря 2006 года), Герой Советского Союза, гвардии рядовой. На фронтах войны с 1941 года, командир отделения 117-го гвардейского отдельного сапёрного батальона 110-й гвардейской стрелковой дивизии 37-й армии Степного фронта.
Имамутдинов Магсум Имамутдинович
(1898 год - 11 марта 1945 года) сапер, уроженец деревни Кызыл Яр Янаульского района. Он строил мосты, наводил переправы, создавал минные поля, на пути наступающего противника. Погиб 11 марта 1945 года, в одном из боев при освобождении Польши. Удостоен звания Героя Советского Союза за мужество и героизм при форсировании реки Одер, посмертно - 10 апреля 1945 года. Похоронен на мемориальном кладбище в польском городе Болеславец, рядом с могилой русского полководца М.И. Кутузова.
