Хронологически экспозиция музея начинается с 22 июня 1941 года и завершается диорамой «Стена Рейхстага». Общий фонд музея включает более 14 500 единиц хранения. В их число входят коллекция холодного оружия, личные вещи участников войны, боевые награды, трофеи, фронтовые дневники и письма и многое другое. Особый интерес представляет коллекция фотографий, отражающих жизнь Башкортостана – тылового района.

Военно-историческая экспозиция размещается по периметру всего здания: вооружение, обмундирование, документы, личные вещи советских бойцов и трофейные материалы, отображено партизанское движение на оккупированных территориях, эвакуация предприятий, работа тыла. 

В экспозиции музея представлены диорамы: «Проводы на фронт», «На страже Московского неба», «Бой у деревни Паньшино», «Блиндаж», «Стена Рейхстага», «Воины-интернационалисты Башкортостана».

В рамках реализации программы «Доступная среда» в музее созданы мультимедийная игровая зона и тактильная экспозиция «Прикоснись к истории» для слабовидящих и незрячих людей.

Для самостоятельного изучения экспозиции музея представлен мультимедийный комплекс Виртуальный гид. Шестиминутный текст гида – это краткая история о Башкортостане в годы Великой Отечественной войны, о вкладе республики в Победу и о героях-уроженцах Башкортостана.

В рамках Республиканской патриотической акции «Истории Победы» в музее создана мультимедийная инсталляция в форме фронтового вагона-теплушки, позволяющая посетителям познакомиться с историями ветеранов, носителями исторической правды о военных событиях.

Два мультимедиа-гида цифровой платформы «Артефакт» в формате дополненной реальности предоставляют информацию по экспозициям «Башкортостан в годы Великой Отечественной войны» и «Воины-интернационалисты Башкортостана».

На официальном сайте музея всем желающим представлена возможность пройти виртуальный тур по парку Победы и Республиканскому музею Боевой Славы.