С началом Великой Отечественной войны в республике быстрыми темпами начинает развиваться легкая промышленность. Эвакуированные предприятия легкой промышленности из Москвы, Ленинграда, Витебска, Украины разместились на существующей сырьевой базе, а эвакуированное оборудование этих отраслей нашло применение в существующих производствах и послужило для значительного расширения и без особых затрат.
Уфимский хлопчатобумажный комбинат, швейные фабрики, кожевенные заводы и обувные фабрики, расположенные в Уфе, Черниковске, Давлеканово, Стерлитамаке, Ишимбае, Бирске давали фронту обмундирование и обувь, маскировочные халаты, противогозные сумки, патронташи, кобуры для пистолетов, ружейные и поясные ремни и многое другое.
На Уфимской кожгалантерейной фабрике при участии «Москожкомбината» была создана шорно-седельная фабрика, выпускавшая снаряжение для кавалерийских частей.
С начала войны и до середины 1944 года швейные и обувные фабрики республики изготовили для фронта более 1 млн. шинелей, 828 тыс. шаровар, 776 тыс. гимнастерок, 1056 тыс. пилоток, 71 тыс. полушубков, 528 тыс. пар обуви, около 3 млн. сумок для противогазов. Текстильные фабрики выпустили 26011 тыс. метров шинельного сукна.
Важную роль в годы войны играли лесная и деревообрабатывающая промышленность. Деревообрабатывающие предприятия: лесофанерный комбинат в Черниковке, фанерный завод №17, лесозавод №3 в Уфе производили фанеру высокого качества для самолетостроения. В артелях Архангельского, Баймакского, Бураевского, Макаровского районов производились сани, брички, лыжи.
В годы войны заметно выросла пищевая промышленность. Вошли в строй овоще-мясоконсервный завод, бисквитная и чаеразвесочная фабрики. За счет эвакуированного оборудования увеличились мощности существующих мельзаводов, маслозаводов, спиртозаводов, макаронной фабрики. Валовая продукция пищевой промышленности к 1945 году увеличилась по сравнению с 1940 годом на 62%.